P1-02 Pythonの基礎 - 数理生物学演習

概要¶

数理生物学では，モデルの挙動をシミュレーションで確かめたり，観察データを可視化したりするためにプログラミングが必要になる．本章では，変数・型・ループ・関数・モジュール・可視化という，後の数理モデル実装で繰り返し登場する基本要素を一通り押さえる．

各要素は後の章で次のように使われます．

この章の内容	後の章での使い方
変数・型	パラメータや個体数を保持する
`for` ループ	時間発展の計算（差分方程式の反復）
関数	モデルの定義をひとまとめにする
`math` モジュール	解析解で使う $\exp$ ， $\log$ ， $\sin$ など
Matplotlib	時系列・相図・分岐図のプロット

学習目標¶

整数（int），浮動小数点数（float），真偽値（bool），文字列（str）の違いを説明できる．
for i in range(N) でループを回し，リストに値を蓄積できる．
引数と戻り値をもつ関数を自分で定義できる．
import でモジュールを読み込み，関数を使える．
plt.plot で折れ線グラフを描き，タイトルと軸ラベルを付けられる．

前提知識¶

P1-01 の環境セットアップが完了していること．

ノートブック¶

01：変数，四則演算，リスト，for ループ
02：関数，モジュール・パッケージ
03：Matplotlibによる可視化
演習で使う数学的ツール